Descripción del Servicio

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La Plataforma de Metabolómica es un servicio de investigación en metabolómica creado para ofrecer apoyo científico-técnico a las tres áreas relacionadas (Ciencias Agrarias, Ciencia y Tecnología de los Alimentos, y Recursos Naturales).del CEBAS-CSIC y a otras instituciones públicas o privadas que pretendan abordar estudios de este tipo.

La Plataforma de Metabolómica pretende, además de ofrecer servicio, colaborar de manera activa en el desarrollo de proyectos y experimentos relacionados con la metabolómica que los grupos propongan. Ello significa que la colaboración debe ser lo más estrecha posible a lo largo de todas las fases del proyecto (desde la definición de los objetivos, hasta el procesado e interpretación de los datos) ayudando así a obtener resultados satisfactorios, significativos y útiles a los grupos.


Plataforma Metabolómica de Alimentos Vegetales
Unión Europea. Proyecto cofinanciado por el Fondo Europeo de Desarrollo Regional

La metabolómica permite analizar una gran cantidad de metabolitos en matrices complejas como biofluidos y tejidos de manera automatizada y relativamente rápida. Este análisis genera un perfil de metabolitos cuya comparación, por medio de técnicas estadísticas multivariantes, permite identificar cambios metabólicos específicos para los distintos fenotipos objeto de estudio. Entre otras cabe destacar las aplicaciones clínicas de la metabolómica, como por ejemplo el descubrimiento de biomarcadores y con ello la diagnosis prematura de ciertas enfermedades; su aplicación al estudio de moléculas candidatas en fase preclínica o el uso de dicha técnica en ensayos sobre eficacia terapéutica.

La reciente instalación de la “Plataforma de Espectrometría de Masas de Ultra Alta Resolución y Resonancia Magnética Nuclear integradas a través de Extracción en Fase Solida en línea (LC-MS_SPE_RMN) (CSIC10-2E-860) - Bruker” cofinanciada con fondos FEDER única a nivel nacional y especialmente diseñada para su uso en metabolómica. Esta plataforma permite realizar la exploración de todos los analitos de bajo peso molecular (metabolitos) presentes en distintos tipos de biofluidos (ej. plasma y/o orina) o en tejidos tanto de humanos como de modelos animales y la elucidación estructural inequívoca de metabolitos capturados selectivamente. Además, la plataforma posee otros equipos de última generación ya presentes en el CEBAS-CSIC, como son el HPLC 1200-DAD-ESI-MSn (HTC Bruker), UPLC-MS-Quadrupolo simple (Agilent), UPLC-Triple Quadrupolo (6460 Agilent) y UPLC-QTOF (6550 Agilent).

El diagrama de trabajo para la investigación en Metabolómica, sea Dirigida o No Dirigida, puede ser llevado a cabo a través de las últimas actualizaciones disponibles de los dos principales software de post-procesado de datos (Mass Profiler Professional-Agilent y Hystar-Bruker) en la Plataforma de Metabolómica del CEBAS-CSIC.

PERSONAL DEL SERVICIO DE METABOLÓMICA
Vallejo Mellado, Fernando Téc. Espec. Grado Medio
metabolomica@cebas.csic.es
Yuste Jiménez, José E. Contrato Proyecto
Ext - 6326
jyuste@cebas.csic.es

MUESTRAS ALIMENTARIAS

APLICACIONES
PRINCIPIOS
EQUIPO EMPLEADO
Vitamina C (AA/DHAA) Identificación y Cuantificación HPLC-DAD-ESI-MSn
Taurina Identificación y Cuantificación HPLC-DAD-ESI-MSn
Amigdalina y Prunasina Identificación y Cuantificación UPLC-UV-QToF-MS
Aminoácidos (20 esenciales) Identificación y Cuantificación UPLC-Triple Quadrupolo
Se-(metil)-seleno-L-Cisteina (SeMC) Identificación y Cuantificación UPLC-QToF-MS
Alicina y derivados Identificación y Cuantificación UPLC-QToF-MS

EXTRACTOS VEGETALES

APLICACIONES
PRINCIPIOS
EQUIPO EMPLEADO
Glucosinolatos (Alifáticos/Indólicos) Identificación y Cuantificación HPLC-DAD-ESI-MSn
Vitamina C (AA/DHAA) Identificación y Cuantificación HPLC-DAD-ESI-MSn
Amigdalina Identificación y Cuantificación HPLC-DAD-ESI-MSn
Isotiocianatos Identificación y Cuantificación UPLC-Triple Quadrupolo
Aminoácidos (20 esenciales) Identificación y Cuantificación UPLC-Triple Quadrupolo
Alcaloides (α-tomatina y tomatidina) Identificación y Cuantificación UPLC-Triple Quadrupolo
Polialcoholes (Sorbitol, Galactinol) Identificación y Cuantificación UPLC-QToF-MS
Azucares, ácidos orgánicos y nucleósidos Identificación y Cuantificación UPLC-QToF-MS

MUESTRAS BIOLÓGICAS (Plasma, Orina, cultivos "in vitro")

APLICACIONES
PRINCIPIOS
EQUIPO EMPLEADO
Vitamina C (AA/DHAA) Identificación y Cuantificación UPLC-Triple Quadrupolo
Taurina Identificación y Cuantificación UPLC-Triple Quadrupolo
Aminoácidos (20 esenciales) Identificación y Cuantificación UPLC-Triple Quadrupolo
Citosinas ADN Hidroximetiladas Identificación y Cuantificación UPLC-Triple Quadrupolo
Prostaglandinas (PGs) Identificación y Cuantificación UPLC-Triple Quadrupolo
SAMe/SAH Identificación y Cuantificación UPLC-Triple Quadrupolo/ UPLC-QToF-MS
Lactulosa/Manitol Identificación y Cuantificación UPLC-Triple Quadrupolo
Nucleósidos/Nucleótidos Identificación y Cuantificación UPLC-UV-QToF-MS
Toxicología (Alcaloides, Benzodiacepinas, Anfetaminas y derivados) Identificación y Cuantificación UPLC-QToF-MS/MS
Eicosanoides (Ac. Grasos Poli-insaturados) Identificación y Cuantificación UPLC-Triple Quadrupolo

MUESTRAS DE AGUA (EDAR, RIO, RIEGO)

APLICACIONES
PRINCIPIOS
EQUIPO EMPLEADO
Contaminación Fármacos Emergentes Identificación y Cuantificación UPLC-QToF-MS/MS
Drogas de Abuso Identificación y Cuantificación UPLC-QToF-MS/MS

ANÁLISIS METABOLÓMICO "NO DIRIGIDO" DE MUESTRAS BIOLÓGICAS Y EXTRACTOS VEGETALES

APLICACIONES
PRINCIPIOS
EQUIPO EMPLEADO
Estudios de Metabolómica “no dirigida” Extracción de los datos crudos (Cromatogramas LC-MS) UPLC-QToF-MS/MS (F.Scan y AutoMS/MS)

ANÁLISIS MEDIANTE 1H-RMN (EXTRACTOS VEGETALES, ALIMENTOS Y MUESTRAS BIOLÓGICAS)

APLICACIONES
PRINCIPIOS
EQUIPO EMPLEADO
Azúcares Identificación y Cuantificación (relativa) AVANCE III HD 500 MHz, CryoProbe Prodigy BBO
Ácidos Orgánicos Identificación y Cuantificación (relativa) AVANCE III HD 500 MHz, CryoProbe Prodigy BBO
Aminoácidos y derivados Identificación y Cuantificación (relativa) AVANCE III HD 500 MHz, CryoProbe Prodigy BBO
Nucleótidos/Nucleósidos Identificación y Cuantificación (relativa) AVANCE III HD 500 MHz, CryoProbe Prodigy BBO
Polialcoholes (Myo-inositol, Galactitol, Sorbitol, Glicerol) Identificación y Cuantificación (relativa) AVANCE III HD 500 MHz, CryoProbe Prodigy BBO
Metabolitos secundarios (Consultar) Identificación y Cuantificación (relativa) AVANCE III HD 500 MHz, CryoProbe Prodigy BBO
Lignanos (SDG) Identificación y Cuantificación (relativa) AVANCE III HD 500 MHz, CryoProbe Prodigy BBO

 

Actualizando la tabla de tarifas del Servicio de Metabolómica para el próximo curso 2016/2017.
Si desea solicitar algún presupuesto ajustado a sus necesidades, póngase en contacto con nosotros por correo electrónico: metabolomica@cebas.csic.es

 

 

 

 

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